经过三个阶段的营建，明故宫算是建成了。只是，三大殿——奉天殿、华盖殿、谨身殿等这些高大宫殿建在原先的燕雀湖中，重力太大又不均衡，这导致了明朝宫殿严重前高后低。按照中国古代的风水术说，后面低，意味着祖先靠自己，没什么根基可凭借，这倒是吻合朱元璋自身的经历;前面高，意味着对未来的儿孙大业不利……
宫城“前昂后洼”，对信风水的朱元璋来说，这是“凶兆”。但迁都未成，65岁的朱元璋心灰意冷，说：“朕经营天下数十年，事事按古有绪。唯宫城前昂后洼，形势不称。本欲迁都，今朕年老，精力已倦。又天下新定，不欲劳民。且废兴有数，只得听天。惟愿鉴朕此心，福其子孙。”当时的朱元璋已经意识到：王朝的兴衰成败自有天命，他只求老天能念在他的一片赤诚之心，造福他的子孙后代。
如果说明故宫的选址违背了古制，属于无意过失，那么后来在宫里发生的众多悬案和惨案就纯属**了，明故宫内到处弥漫着死亡气息。朱元璋的猜忌心特别重，当年辅佐他夺天下的功臣，除了沐英，都成了刀下冤魂。朱元璋当政时，掀起过两次杀人狂潮，一次是胡惟庸案，一次是蓝玉案，两次杀戮，一共有10万人死去。而这些决策都是在奉天殿定的。朱元璋辞世当天，那些没有生养的妃子们遭了殃，一个个在后宫被勒令上吊而死。这批冤死的宫女、妃子至少有43人。
也许是杀戮太多，朱元璋当政时期，明故宫一带就陆续出现怪事。说起来也很玄乎。
洪武十五年以后，朱元璋的皇室家族屡屡出现神秘死亡事件，朱元璋的长子、长孙、二儿子、三儿子陆续神秘死亡。洪武十五年，身体一向很好的大脚马皇后突然肚子疼，当时，朱元璋请来了太医，但马皇后说：“不用请太医看了，人早死也是死，晚死也是死。你就算让太医开了药，我也不吃。”拒吃药的马皇后不久就在坤宁宫去世了，享年56岁。马皇后的死亡不可能是谋杀，她也不是醋坛子，她的死充满了神秘。
马皇后死后不久，只有五六岁的朱雄英也夭折了。朱雄英是太子朱标的长子，死因不明。紧接着，朱标的妻子、太子妃常氏也突然抱病，很快去世了。1392年，朱标去了一趟西安，就染上了风寒，回到家就死在了东宫。从1382年到1392年，10年之内，朱元璋痛失了4位他非常喜爱的家人。
但事情似乎并没有结束，朱标去世后，他同胞兄弟秦王朱樉，就是朱元璋的二儿子也去世了;洪武三十一年，朱标的二弟晋王朱-也去世了。这年的农历六月，朱元璋初八感觉身体不爽，初十就死了。
朱元璋驾崩，其孙子朱允炆即位。但朱允炆的屁股还没坐热，他的叔叔朱棣就起兵了。
朱棣当上皇帝后，在奉天殿发誓一定要捉拿奸臣，于是他开了一个奸党分子名录，这个名录上有29人。由于朱棣大开杀戒，南京一度成为人间地狱，爆发了“壬午殉难”，一共有100多名大臣先后被杀。
在朱棣夺得江山之前，姚广孝就劝诫朱棣，到了南京后，谁都可杀，唯独有一个人万万杀不得，那就是方孝儒，杀了方孝儒就失去了人心。到南京后，朱棣对方孝儒一再忍让。
有一天，他召方孝儒进宫，方孝儒披麻戴孝上朝了。
方孝儒见到朱棣，就斥责：“你为什么要造反?”
朱棣说：“仿效周公辅助成王。”
“成王在哪?”
“烧死了?”
“你为何不辅助成王的弟弟或儿子?”
朱棣被问得火冒三丈，逼方孝儒写登基诏书，方孝儒写了四个字：燕贼篡位。
这招来了杀身之祸，在奉天殿上，朱棣命人割了方孝儒的耳朵。而后，从耳朵一直割到嘴巴，血流不止。朱棣还不解气，命刽子手把方孝儒拖到午门杀了。
传说，现在午朝门遗址公园内的一块石头就是被方孝儒的血溅到而被称为“血溅石”。
永乐年间，皇宫屡屡发生诡异事件，太监宫女每月都会莫名死上三五人。
为此，朱棣也百感交集，彻夜不能眠。
对于这些诡异的事件，都说是朱元璋和马皇后的鬼魂对朱棣的篡权不满，所以才会在黑夜来临时在皇宫作乱。
朱棣因为
第192章明故宫中