“可恶，怎么.....一直是这样么，难不成我们的努力都白费了吗？”柯南眉头紧皱。双手插着口袋，目光紧紧盯着显示屏。
自从黑衣人那里得到他们最新研发的产品APTX-3000天天埋头实验室，想找寻到身体变小的外因素。
“还是没有结果吗？看来得让阿笠博士来帮忙了”灰原手捧着咖啡，悠然站在柯南身后。
柯南想了想。但他还是有所顾虑，若是找阿笠博士帮忙。就会知道他的计划。“不行，不能告诉阿笠博士，但我需要用到它的最新基因实验室。如果可以，你也可以变回原来，雪莉。”
“不，不要，我不要做回雪莉，我不想被组织的人抓到，但我可以帮你研制解药，新一”灰原惊慌的捂着耳朵，不想将过去再回忆起来。
灰原与柯南决定偷用阿笠博士的实验室。
柯南回到家中，看着沙发上侧躺着喝着醉醺醺的毛利小五郎，微微一笑，走进了自己的房间。看了看表，等待着晚上的行动。“你回来了，柯南？”这一声，吓到正在沉思中的柯南，原来是小兰推开了他的房门。“是你啊，小兰姐，我刚回来，出去踢了会球。”“好的，那你一会记得来吃晚饭哦”小兰看着手机里圆子发来的同学聚会照片，哼着小曲出了柯南的房间。柯南看着小兰的背影，心里说到：兰，我马上就会回来的，很快我就会来到你身边。
夏日的晚风微微吹拂着，闷热的天气让人一刻都不想离开吹着空调的房间。灰原哀已经到了柯南家的楼下，给柯南发了条短讯。柯南起身收拾好东西。走出房门，到客厅给小兰姐和小五郎叔叔说“我出去一下小兰姐，很快回来，晚饭你们先吃了”“这么晚了去哪啊小鬼？”小五郎一个葛优瘫，头也不正问道柯南。“叔叔我就出去一下，你们吃完饭吧不用等我了。”说完就噔噔噔跑下楼。
灰原舔着雪糕，看着柯南匆忙的跑下楼，“带的东西带了吗？”柯南气喘吁吁的说到，“看你累的，下个楼梯至于这么着急吗？东西我都带到了，我联系组织的一个同伴给我帮忙搞到了另一种基因药物，目前她也准备脱离组织，我们可以用到。”“那我们就出发吧，希望阿笠博士不会过来。”柯南放下滑板，与灰原哀前往阿笠博士的最新基因实验室。
然而阿笠博士早已经料到他们会拿到组织的最新药品，已经在实验室等着他们，作为组织的最大头目，阿笠博士所做的一切都是在他的计划中，他也会让柯南重新变回新一，这样组织就可以顺利去找到工藤优作与工藤有希子二人，拿到他们最新的资料，来解决掉昔日的事情。
柯南与灰原到了实验室后并没有发现阿笠博士的车就停在门口，两人悄悄潜入了实验室，柯南用眼镜扫描了一下，没有发现活物移动镜像，安稳的走到了大厅中央。大厅四面宽广。中间放着一台基因重组机器。就在他们打量着这台机器的时候。四面灯光亮起，所有机器启动，伴随着一阵阵的脚步声，柯南清楚的知道了阿笠博士在此等他。
“柯南，小哀，你们来此想做什么呢”“。。。。。”“噢什么都不需要说了，我都已经知道了，你们拿到了黑衣组织的最新药品，想要用我的设备完成你们的测试对吧？放心吧柯南，我会帮你完成的，”柯南想着这博士是想做什么呢？难道他与组织有关?或又是谁走漏风声?他看看灰原，灰原默默的摇摇头，她也不知道是什么情况。“来柯南，把APTX-3000给我吧，现在开始研制解药，我这里也有研制的解药，但没来得及做实验，这次就一起用上吧。”阿笠博士走到柯南跟前。“博士你为什么想帮我们呢？”博士大笑道“不为什么，你要知道，我一直都在做解药试验，如果新一你可以变回去，那么我们就意味着解药成功，意味着可以研发更多的解药来对付组织的各种产品。”博士边说边启动着机器，柯南想了想，给了博士药品，至此只能一搏了，如果成功，他就可以回到父母跟前，可以回到小兰身边，总是跟个电话谈恋爱，还谈那么久，放谁时间久了都会有点难受。他告诉博士“这次只能成功，不能失败，而且不要跟以前一样，只有一个时辰的药效”“放心吧新一，这个解药我已经做过分析了，他的改善基因效果非比寻常，跟之前接触的药品很不一般，新一，在注射这个药物之前，你得有所心理准备，或许会吞噬你
第1章 王者归来